＜あらすじ＞
物語の舞台となるのは、霧につつまれた島ミスティアイランド。偶然にその島に漂着したトーマスは、ダッシュ、バッシュ、ファーディナンドという３台の蒸気機関車と出会う。なんとかソドー島に帰ろうと知恵をしぼるトーマスは、やがてミスティアイランドとソドー島がトンネルでつながっていることを知る。ダッシュ、バッシュ、ファーディナンド、新しいなかまとともに強引にトンネルを進むトーマスだが、途中でトンネルが崩れ閉じ込められてしまう…一方、行方不明になったトーマスをさがすためにソドー島では、なかまみんなで大捜索。心配しながら海をみつめていた親友の蒸気機関車・パーシーが、トーマスの吐き出す救助を求める煙を発見する。ウィフと共にトンネルから救助にむかうパーシー。海上からはボートのキャプテンがトップハム・ハット卿を乗せて大奮戦！はたしてトーマスは無事にみんなのところに帰れるのか…！？