＜あらすじ＞
武藤遊戯がいた時代から数十年後の童実野町。そこは、階層社会を形勢する未来都市「ネオ童実野シティ」へと変貌していた。主人公・不動遊星はデュエルディスクの発展系「D・ホイール」に乗り、下層エリアから上層エリアを目指し疾走する。自分と仲間にとって大切なカード「スターダスト・ドラゴン」を奪っていったジャック・アトラスのいるデュエルスタジアムを目指して。ついに対峙する遊星とジャック。それぞれの思いを胸に彼らのエースモンスターである「スターダスト・ドラゴン」と「レッド・デーモンズ・ドラゴン」が激突する! 2体のドラゴンのバトルは謎の「赤き竜」を出現させ、遊星の腕に「竜の痣」を浮かびあがらせる。「竜の痣」が導くそれぞれの運命がここから始まる。仲間のために戦う遊星に待ち受けるものは?!そして「竜の痣」がもたらすものとはいったい何なのか?!