＜あらすじ＞
両親の離婚によって、フロリダの小島で、一夏を過ごすことになった14歳の少年サンディ（イライジャ・ウッド）。島に住む変わり者の叔父ポーター（ポール・ホーガン）との共同生活が始まるが、ある日船着き場で、一頭のイルカに遭遇。人懐っこいこのイルカを“フリッパー”と名づけたサンディは、いつしか心を通わせていく。だが、この島ではイルカを飼うことを禁じられていた。大人たちは、嫌がるサンディから、フリッパーを引き離してしまう。あきらめきれない彼は、その夜フリッパーを探しにボートで海へ。そこで彼は偶然、何かを海に投棄する不審な船を目撃する。翌日浜辺でぐったりしているフリッパーを見つけるが･･･。