＜あらすじ＞
日本征服を企む血車党の党首･魔神斉は、谷の鬼十から奪った秘術で化身忍者を生み出し、悪事を働いていた。血車党の忍者･ハヤテは、そんな彼らの悪行に耐え切れず、父･谷の鬼十により化身忍者に改造。"吹けよ嵐!嵐!嵐!"の掛け声とともに変身忍者嵐に変身するハヤテは、伊賀の生き残り･名張のタツマキ親子を仲間に得て、悪の化身忍者を作った父の罪を償うため、日本の平和を守るために、血車党の血の掟を破って化身忍者に挑む! 「仮面ライダー」の大ヒットによる"へんしんブーム"の真っ只中に製作された「変身忍者嵐」は、へんしんヒーローの新たな局面を模索する中、忍者･怪奇路線にオリジナリティを求めて作られた。こうして舞台背景を変えることにより、「仮面ライダー」の物語の基本構造や怪人のイメージ等をほぼそのまま受け継いだ本作は、数ある兄弟作品の中でも、最もオリジナルに近い存在として誕生。時代劇版「仮面ライダー」となった。