＜あらすじ＞
新学期。美墨なぎさと雪城ほのかもいよいよベローネ学院女子中等部の最上級生。メップルとミップル、ポルンは眠りにつき、ふたりは普通の女の子として、部活や勉強に大忙しの学校生活を送っていた。そのころ「光の園」では、ジャアクキングとの戦いで傷ついたクイーンが分裂し、どこかへ消え去ってしまった。時を同じくして、撃退されたはずの邪悪な闇の力「ザケンナー」がなぎさとほのかを襲う!バージョンアップした「コミューン」にハートのカードを差し込むと、再びふたりはプリキュアに変身!しかも前より断然パワーアップしてる!?記憶を失い、姿形も変わってしまったクイーンを元に戻すため、なぎさとほのか、パワーアップして目覚めたメップルやミップル、ポルンたちが、不思議な少女・九条ひかりと共に、未来を信じて、今、立ち上がる!!はたしてプリキュアはクイーンを元の姿にもどすことができるのか!?