＜あらすじ＞
大気圏突入を控えたアークエンジェルに総攻撃を仕掛けるクルーゼ隊。第8艦隊の全力の援護もあったが、4機のガンダムをはじめとするザフト軍の猛攻の前に、連合軍の戦艦は次々と沈められていく。艦を守るため、決意を新たに出撃するキラ。しかし、イザークのデュエルに執拗なまでに阻まれてしまう。激しい戦闘の末、大気圏に突入していくストライク。なんとか救助されたキラではあったが、受けたダメージは大きく、高熱に倒れてしまうのだった。 そして、数々の犠牲を代償に、やっとの思いでアークエンジェルが降下したのは、ザフト勢力圏のアフリカ。いきつく暇もなく、ザフト軍の砂漠の虎;と呼ばれるアンディー・バルトフェルドの部隊が襲い掛かる!